Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc73Q8CDM4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms