Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E4f1Q8CCE9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms