Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdac7Q8C2B3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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