Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Atg16l1Q8C0J2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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