Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtpaQ8BWP5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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