Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pdcl3Q8BVF2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcl3Q8BVF2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms