Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms