Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdca8Q8BHX3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms