Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms