Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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