Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.6Q85ZW5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms