Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39bQ810L4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms