Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pcsk9Q80W65 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pcsk9Q80W65 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms