Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms