Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms