Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms