Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms