Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms