Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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