Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b3Q6UQ17 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms