Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmeff1Q6PFE7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms