Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms