Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb40Q6PCS8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zbtb40Q6PCS8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbtb40Q6PCS8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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