Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nop58Q6DFW4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms