Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim24Q64127 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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