Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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