Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift88Q61371 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift88Q61371 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift88Q61371 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift88Q61371 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift88Q61371 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift88Q61371 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift88Q61371 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift88Q61371 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms