Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms