Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cnot7Q60809 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cnot7Q60809 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cnot7Q60809 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cnot7Q60809 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot7Q60809 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms