Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms