Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp13a3Q5XF89 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms