Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVL9

Prl2c1, Growth hormone d22, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl2c1Q5SVL9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prl2c1Q5SVL9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms