Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms