Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms