Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Trappc1Q5NCF2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Trappc1Q5NCF2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Trappc1Q5NCF2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Trappc1Q5NCF2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Trappc1Q5NCF2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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