Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Taf3Q5HZG4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Taf3Q5HZG4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Taf3Q5HZG4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Taf3Q5HZG4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Taf3Q5HZG4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Taf3Q5HZG4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Taf3Q5HZG4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf3Q5HZG4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms