Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp235Q499D5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms