Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5935Q497S0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5935Q497S0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms