Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp48Q3V0C5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp48Q3V0C5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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