Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Capn13Q3UW68 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Capn13Q3UW68 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn13Q3UW68 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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