Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28047Q3US59 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms