Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms