Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem253Q3UNB8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tmem253Q3UNB8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tmem253Q3UNB8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Tmem253Q3UNB8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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