Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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