Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fhdc1Q3ULZ2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms