Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms