Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nkx6-3Q3UHX8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Nkx6-3Q3UHX8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Nkx6-3Q3UHX8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Nkx6-3Q3UHX8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms