Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hvcn1Q3U2S8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hvcn1Q3U2S8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms