Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt1Q3TX08 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms