Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ctdnep1Q3TP92 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ctdnep1Q3TP92 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ctdnep1Q3TP92 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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